40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0115 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  100 
 
 		 438 aa  887    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  54.11 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  54.15 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  54.15 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  39.06 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  38.88 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  36.05 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 536 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  34.7 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  35.83 
 
 		 410 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  34.16 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 540 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.57 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  32.21 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  32.51 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  31.54 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  31.21 
 
 		 532 aa  219  7.999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  31.38 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  30.43 
 
 		 398 aa  206  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.38 
 
 		 342 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  32.49 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  29.26 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  31.92 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  29.39 
 
 		 270 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  39.17 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  39.17 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  28.91 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 617 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.25 
 
 		 1079 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 621 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.7 
 
 		 176 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.71 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.05 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  22.12 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>