45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0510 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 532 aa  1097    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  42.62 
 
 		 517 aa  382  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  36.53 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  36.67 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  37.64 
 
 		 395 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  35.87 
 
 		 407 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  34.74 
 
 		 406 aa  262  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  34.51 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  36.71 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  37.09 
 
 		 421 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  31.75 
 
 		 536 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  30.78 
 
 		 491 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.54 
 
 		 342 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  33.18 
 
 		 398 aa  231  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 398 aa  231  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  31.27 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 		 432 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  31.38 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 		 433 aa  209  9e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  29.93 
 
 		 391 aa  196  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  34.15 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  31.69 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 316 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  34.43 
 
 		 140 aa  87.8  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  24.71 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  30.71 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  27.13 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  25.53 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2668  Domain of unknown function DUF1858  50 
 
 		 74 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  27.35 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1604  hypothetical protein  42.47 
 
 		 75 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.334273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  31.67 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1719  hypothetical protein  41.79 
 
 		 80 aa  57.4  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.188427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.17 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.81 
 
 		 459 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  31.94 
 
 		 200 aa  53.9  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  32.08 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 621 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 615 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.5 
 
 		 1079 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>