42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1165 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  100 
 
 		 491 aa  1013    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  45.81 
 
 		 536 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.91 
 
 		 521 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  40.59 
 
 		 411 aa  316  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  41.21 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  37.72 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  38.18 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.55 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  35.7 
 
 		 406 aa  269  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  37.1 
 
 		 421 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  36.86 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  35.65 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  30.53 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  34.98 
 
 		 485 aa  243  7e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  30.17 
 
 		 517 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  37.31 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  34.36 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 398 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.45 
 
 		 342 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  34.99 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  31.57 
 
 		 432 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 		 322 aa  211  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.03 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  25.1 
 
 		 434 aa  144  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  26.56 
 
 		 270 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  25.2 
 
 		 270 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  32.2 
 
 		 140 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  29.77 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  23.66 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  29.75 
 
 		 148 aa  67  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.89 
 
 		 1079 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.61 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 621 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 615 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  30.12 
 
 		 258 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  31.68 
 
 		 148 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  38.57 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>