41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2103 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  100 
 
 		 321 aa  665    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  53.14 
 
 		 322 aa  342  7e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  45.6 
 
 		 391 aa  288  7e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  38.81 
 
 		 536 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  37.31 
 
 		 491 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.54 
 
 		 521 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  38.62 
 
 		 517 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  36.53 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.86 
 
 		 540 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  37.77 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  35.93 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  39.38 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  35.26 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.98 
 
 		 342 aa  208  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 		 432 aa  192  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  31.29 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  32.32 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 		 532 aa  182  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  32.49 
 
 		 438 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  33.14 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 433 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  31.67 
 
 		 485 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  29.57 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  30.86 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  30.83 
 
 		 434 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  85.9  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  32.23 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  25.45 
 
 		 463 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  26.63 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  27.22 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  29.55 
 
 		 227 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0231  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.63 
 
 		 972 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1806  oxidoreductase, putative, truncated  24.41 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 617 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  26.13 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  31.13 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 621 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 		 1079 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>