32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2152 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  35.52 
 
 
258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  42.36 
 
 
176 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  36.81 
 
 
175 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  37.57 
 
 
175 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  28.89 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  35.54 
 
 
175 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  38.19 
 
 
177 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  35.54 
 
 
175 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3309  hypothetical protein  29.78 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3387  hypothetical protein  30.25 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2290  hypothetical protein  46.99 
 
 
98 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0978104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3190  hypothetical protein  28.81 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0699  hypothetical protein  26.49 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700264  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  53.03 
 
 
69 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25490  protein of unknown function (DUF1858)  26.07 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  29.68 
 
 
174 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.255933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40 
 
 
521 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0700  hypothetical protein  39.13 
 
 
92 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  36 
 
 
79 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  42.42 
 
 
85 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 
536 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1507  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116491  normal  0.0112216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0171  hypothetical protein  35.82 
 
 
87 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474902  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  40.62 
 
 
77 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1765  hypothetical protein  44.44 
 
 
106 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  39.06 
 
 
73 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  38.57 
 
 
491 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3275  hypothetical protein  40.62 
 
 
77 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.19 
 
 
540 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1976  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0298563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>