11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0171 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0171  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1976  hypothetical protein  65.88 
 
 
86 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0298563  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1159  hypothetical protein  67.12 
 
 
108 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.255933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1765  hypothetical protein  45.92 
 
 
106 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  43.55 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1507  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116491  normal  0.0112216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  36.62 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  35.82 
 
 
276 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  39.39 
 
 
175 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1890  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  41.67 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>