26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4282 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  346  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  57.14 
 
 
175 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  55.62 
 
 
176 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  54.76 
 
 
175 aa  175  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  54.76 
 
 
175 aa  175  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  53.22 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  36.81 
 
 
276 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2290  hypothetical protein  49.33 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0978104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0699  hypothetical protein  24 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700264  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  30.06 
 
 
258 aa  57.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  28.57 
 
 
174 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1554  hypothetical protein  42.65 
 
 
77 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  41.18 
 
 
79 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  52.4  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  52.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3275  hypothetical protein  55.77 
 
 
77 aa  51.2  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  34.33 
 
 
69 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  37.31 
 
 
85 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0997  hypothetical protein  39.06 
 
 
75 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2358  hypothetical protein  38.75 
 
 
96 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25490  protein of unknown function (DUF1858)  34.78 
 
 
344 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1976  hypothetical protein  37.04 
 
 
86 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0298563  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.68 
 
 
540 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1890  hypothetical protein  35.82 
 
 
72 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0171  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  41.6  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1763  hypothetical protein  46 
 
 
76 aa  41.2  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>