13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2290 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2290  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  197  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0978104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  46.99 
 
 
276 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  55.22 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  49.33 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  45.45 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  51.47 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  51.47 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0699  hypothetical protein  31.71 
 
 
203 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700264  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1554  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  36 
 
 
79 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25490  protein of unknown function (DUF1858)  30 
 
 
344 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  31.52 
 
 
253 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>