26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1458 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  57.71 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  57.67 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  53.49 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  53.49 
 
 		 175 aa  180  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  48.59 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  37.57 
 
 		 276 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2290  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0978104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  35.76 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  38.89 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0699  hypothetical protein  25.28 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1554  hypothetical protein  42.03 
 
 		 77 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3275  hypothetical protein  48.15 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0495516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1763  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  34.29 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0171  hypothetical protein  39.39 
 
 		 87 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1159  hypothetical protein  43.55 
 
 		 108 aa  45.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.255933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0997  hypothetical protein  38.46 
 
 		 75 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 540 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2358  hypothetical protein  42.31 
 
 		 96 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1976  hypothetical protein  34.25 
 
 		 86 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0298563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>