16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1157 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  55.88 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1763  hypothetical protein  57.14 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3275  hypothetical protein  55.88 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  40.28 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  38.6 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25490  protein of unknown function (DUF1858)  41.27 
 
 
344 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  39.29 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  39.29 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  38.46 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  43.33 
 
 
85 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0997  hypothetical protein  39.13 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  39.06 
 
 
276 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1554  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>