13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1554 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1554  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  41.67 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  46.97 
 
 
177 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  46.27 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  46.27 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  42.65 
 
 
175 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  42.65 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2290  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0978104  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  36.23 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3275  hypothetical protein  37.88 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0495516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  31.82 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  34.78 
 
 
276 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>