25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6281 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  58.76 
 
 		 175 aa  207  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  58.76 
 
 		 175 aa  207  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  54.86 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  55.62 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  57.06 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  42.36 
 
 		 276 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2290  hypothetical protein  55.22 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0978104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0699  hypothetical protein  24.16 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1554  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0905  hypothetical protein  39.71 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  38.6 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3275  hypothetical protein  42.65 
 
 		 77 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0495516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  31.69 
 
 		 258 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  40.35 
 
 		 77 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  26.9 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  38.18 
 
 		 85 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1763  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  49.06 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  44.9 
 
 		 69 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 540 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  30.22 
 
 		 354 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1507  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116491  normal  0.0112216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2358  hypothetical protein  39.22 
 
 		 96 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>