13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1507 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1507  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  249  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116491  normal  0.0112216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0171  hypothetical protein  42.86 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1765  hypothetical protein  43.1 
 
 
106 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  40.91 
 
 
276 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1976  hypothetical protein  36.51 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0298563  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0700  hypothetical protein  41.79 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1159  hypothetical protein  40.3 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.255933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2358  hypothetical protein  43.86 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  36.99 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0699  hypothetical protein  39.13 
 
 
203 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.700264  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  35.14 
 
 
253 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  29.73 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>