45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3310 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  95.18 
 
 
421 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  100 
 
 
415 aa  840    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  41.67 
 
 
411 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  40.44 
 
 
395 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  42.22 
 
 
407 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.7 
 
 
540 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  41.19 
 
 
410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  41.3 
 
 
536 aa  292  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.97 
 
 
398 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39 
 
 
521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  36.61 
 
 
485 aa  272  8.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  38.7 
 
 
517 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  37.47 
 
 
532 aa  262  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  37.14 
 
 
491 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.39 
 
 
342 aa  257  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  33.66 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  34.16 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 
433 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  33.41 
 
 
391 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  33.26 
 
 
433 aa  226  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  37.72 
 
 
322 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  37.13 
 
 
321 aa  212  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  31.54 
 
 
438 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  31.2 
 
 
517 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  27.23 
 
 
434 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.01 
 
 
316 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  36.21 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  36.07 
 
 
140 aa  90.1  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  23.83 
 
 
270 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  21.79 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  23.5 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.5 
 
 
463 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
615 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
621 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
617 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.45 
 
 
1079 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.36 
 
 
459 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
842 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  25 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  25 
 
 
458 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
841 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310558  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2930  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  20.69 
 
 
457 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  20.69 
 
 
457 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>