More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0440 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0263  conserved hypothetical protein TIGR00044  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.456825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0440  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.475381  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  53.5 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  54.77 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  52.71 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  54.27 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  53.27 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  53.27 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  53.27 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 234 aa  187  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  52.76 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  53.81 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  53.77 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  49.75 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  50 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2418  hypothetical protein  53.77 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  50.5 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  46.85 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  47.96 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0268  hypothetical protein  45.85 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0294  hypothetical protein  46.34 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  42.11 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  40.79 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  47.58 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  41.38 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  51.1 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0930  alanine racemase domain protein  49.53 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246462  normal  0.758463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  46.31 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  48.76 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  43.86 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1883  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  43.64 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  51.1 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  48.9 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  50.75 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  46.23 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  51.24 
 
 		 268 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  46.27 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  45.77 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  42.54 
 
 		 232 aa  157  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  44.74 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  47.66 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  40.17 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  50.75 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  48.13 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0545  alanine racemase domain-containing protein  45.73 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  50.25 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  50.25 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  40.43 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  42.11 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  41.21 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  41.1 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  42.79 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41.2 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  49.75 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  42.79 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  41.41 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  42.11 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  42.11 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  47.16 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01992  hypothetical protein  47.29 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  41.67 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  41.23 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  41.23 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  40.77 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.77 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  40.97 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  40.77 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2682  hypothetical protein  41.28 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00281403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3040  alanine racemase domain-containing protein  42.31 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  48.46 
 
 		 232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0328  hypothetical protein  49.5 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2411  hypothetical protein  49.5 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2598  hypothetical protein  49.5 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.734317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1189  hypothetical protein  49.5 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3346  hypothetical protein  49.5 
 
 		 305 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3299  hypothetical protein  49.25 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  42.36 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  40.77 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3333  hypothetical protein  49.25 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  45.15 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2655  alanine racemase domain-containing protein  49.75 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>