93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3808 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  968    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  39.04 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  34.69 
 
 		 618 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  30.35 
 
 		 736 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.68 
 
 		 845 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.38 
 
 		 594 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.16 
 
 		 613 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  33.67 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  30.5 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.85 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.95 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.64 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30.73 
 
 		 668 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.35 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.43 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  26.67 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  30.46 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  32.5 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.77 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 		 664 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  26.96 
 
 		 626 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.63 
 
 		 696 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  30.05 
 
 		 560 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  27.37 
 
 		 625 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.32 
 
 		 627 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 632 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.26 
 
 		 728 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.7 
 
 		 702 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.23 
 
 		 653 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.46 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  25.37 
 
 		 625 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 710 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  31.17 
 
 		 331 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 624 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  28.72 
 
 		 367 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.56 
 
 		 880 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.56 
 
 		 880 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.44 
 
 		 825 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24.58 
 
 		 1373 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.74 
 
 		 660 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.7 
 
 		 645 aa  50.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.22 
 
 		 648 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 624 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 624 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  25.58 
 
 		 672 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  30.85 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  24.39 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 612 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.64 
 
 		 681 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.34 
 
 		 650 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 612 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.1 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  29.69 
 
 		 705 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  26.37 
 
 		 530 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.03 
 
 		 947 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.67 
 
 		 601 aa  46.6  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30.71 
 
 		 658 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1067  hypothetical protein  27.78 
 
 		 676 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  29.47 
 
 		 797 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.92 
 
 		 676 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 721 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1016 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.8 
 
 		 658 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.63 
 
 		 673 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.9 
 
 		 1611 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1016 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.88 
 
 		 1348 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 		 1363 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 625 aa  44.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.38 
 
 		 641 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.76 
 
 		 621 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  28.87 
 
 		 266 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  29.03 
 
 		 374 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 723 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.55 
 
 		 1048 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.7 
 
 		 662 aa  44.3  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 		 1656 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 		 636 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  22.88 
 
 		 598 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  25.77 
 
 		 597 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 708 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  23.31 
 
 		 290 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.98 
 
 		 681 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>