66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2913 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  46.39 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  44.41 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  44.13 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  41.69 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  45.19 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  41.55 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  43.73 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  42.31 
 
 		 323 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  40.12 
 
 		 337 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  39.12 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  38.32 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  35.59 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  34.71 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  35.59 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  33.53 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  32.54 
 
 		 317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  34.09 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  35.8 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  35.8 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  37.65 
 
 		 352 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  34.26 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  30.79 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  33.74 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.59 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  33.44 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  33.44 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  34.31 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  32.24 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  32.76 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  34.19 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  36.2 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  32.65 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  32.84 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.28 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.09 
 
 		 316 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  26.35 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.58 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.55 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  31.68 
 
 		 943 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  25.71 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  20.73 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  29.15 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  21.9 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.17 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  28.53 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  25.58 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.58 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  26.74 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  24.45 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.29 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  27.12 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  28.91 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.67 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.55 
 
 		 552 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.29 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  26.72 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  28.94 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  28.94 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  28.37 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.37 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.37 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  26.44 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  26.71 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 		 267 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>