67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2207 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 483 aa  954    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  46.42 
 
 		 493 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  41.59 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  41.59 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  39.86 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  38.18 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  39.33 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  38.55 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  37.58 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  38.85 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  36.72 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  32.95 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  31.01 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  24.92 
 
 		 453 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  29.49 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  27.95 
 
 		 474 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  26.68 
 
 		 447 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  29.35 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.48 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  28.12 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  28.12 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  28.12 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  28.12 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  30.49 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  28.01 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  26.21 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  25.52 
 
 		 494 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  26.1 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  25.17 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  25.52 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  25.42 
 
 		 502 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  25.25 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  22.8 
 
 		 467 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  34.86 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  22.91 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  28.92 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  26.39 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  26.39 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  26.39 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  26.39 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  26.39 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  26.39 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  26.39 
 
 		 472 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  26.2 
 
 		 477 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  25.44 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3131  carbohydrate kinase FGGY  23.74 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  21.03 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  20.5 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4389  carbohydrate kinase, FGGY  33.94 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4476  carbohydrate kinase, FGGY  33.94 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4770  carbohydrate kinase, FGGY  33.94 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  28.62 
 
 		 480 aa  47.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.31 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  36.79 
 
 		 549 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  26.89 
 
 		 501 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  23.88 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  24.63 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.2 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  24.72 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  31.11 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  25.56 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  26.62 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  26.32 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  26.71 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  30 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  21.72 
 
 		 502 aa  43.5  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  25.71 
 
 		 484 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>