More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2098 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2098  arginase  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  78.72 
 
 		 311 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  76.95 
 
 		 321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  74.47 
 
 		 304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  73.4 
 
 		 305 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  74.38 
 
 		 310 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  72.28 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  70.11 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  68.33 
 
 		 307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  64.66 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  67.26 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  64.66 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  67.26 
 
 		 304 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  64.79 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  63.7 
 
 		 307 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  62.46 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  49.47 
 
 		 311 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  47.72 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  47.72 
 
 		 308 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  49.29 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  48.25 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  47.16 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  46.62 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  46.32 
 
 		 324 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  44.83 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  43.46 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  47.52 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  48.04 
 
 		 318 aa  228  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  46.1 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  47.86 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  43.97 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  42.91 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  44.06 
 
 		 325 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  46.34 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  46.62 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  42.81 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  42.65 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  45.33 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  43.01 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  45.23 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  45.07 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  42.86 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  43.77 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  44.52 
 
 		 306 aa  214  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  45.07 
 
 		 327 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  45.3 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  44.17 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  43.6 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  41.79 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  38.03 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  38.03 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  42.71 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  43.06 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  40.07 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  39.71 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  39.71 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  39.71 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  39.71 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  43.94 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  45.58 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  40.77 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  44.6 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  44.88 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  39.72 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  39.86 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  42.11 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  40.14 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  43.11 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  43.36 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  43.11 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  43.01 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  37.89 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  38.18 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  40.08 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  37.44 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  35 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  37.67 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.67 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  34.15 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  35.27 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.68 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.71 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.19 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  33.47 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.62 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.94 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.84 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  27.8 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.49 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.37 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.98 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  29.91 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.91 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>