91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1279 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  801    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  59.43 
 
 		 374 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  53.25 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  56.07 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  54.1 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  54.62 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  55.81 
 
 		 374 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  53.16 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  53.26 
 
 		 377 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  50.48 
 
 		 392 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  46.67 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  46.63 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  46.44 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  46.7 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  44.96 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  41.88 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  41.88 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  36.13 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  37.26 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  38.22 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  39.54 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  36.84 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  35.86 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  36.78 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  34.79 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  37.54 
 
 		 376 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  35.08 
 
 		 378 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  37.93 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  35.99 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  35 
 
 		 386 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  38.92 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  35.77 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  33.68 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  34.81 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  35.92 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  36.36 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  36.23 
 
 		 346 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  36.16 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  32.65 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  37.08 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  34.41 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  36.36 
 
 		 364 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  32.95 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  35.21 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  35.21 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  30.41 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  33.78 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  35.19 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  31.45 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  36.31 
 
 		 335 aa  153  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  35.28 
 
 		 364 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  33.62 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  30.77 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  33.05 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  30.32 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  29.95 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  33.05 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  34.88 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  30.99 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  29.1 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  28.99 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  28.64 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  30.42 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  32.09 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  31.4 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  30.03 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  33.04 
 
 		 360 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  33.62 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  31.41 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  26.7 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  30.81 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  31.89 
 
 		 360 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  30.88 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  29.35 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  27.61 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  29.21 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  28.08 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  27.42 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  28.33 
 
 		 374 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  25.94 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  28.44 
 
 		 355 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  25.56 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  25.36 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  27.04 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  22.96 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  23.83 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  26.03 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5452  secreted hydrolase-like protein  27.36 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.275978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>