More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1528 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  61.23 
 
 		 275 aa  335  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  57.66 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  57.25 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  57.09 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  56.41 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  54.35 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  55.12 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  47.23 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  45.93 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  43.01 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  44.78 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  43.91 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  44.07 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  43.82 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  42.8 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  42.59 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  44.4 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  42.44 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  42.44 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  42.44 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  42.44 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  41.7 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  42.28 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  42.75 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  42.38 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  40.81 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  37.25 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  40.74 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  40.6 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  39.47 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  39.1 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  39.71 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  39.93 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  38.6 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  37.04 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  34.31 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  36.16 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  33.58 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  35.77 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.83 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  33.82 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  35.31 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  34.16 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  32.6 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  33.58 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  32.12 
 
 		 336 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  31 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  34.8 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  31.99 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  36.13 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  32.49 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.09 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  31.87 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  30.4 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  31.14 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  33.45 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  33.83 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  32.73 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  36.8 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  32.36 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  30.21 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  32.14 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  32.22 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  32 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  29.3 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  32 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  33.09 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  30.94 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  32.07 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  29.57 
 
 		 489 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  31.16 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  30.66 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  32.13 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  32.13 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  30.47 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  30.15 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.76 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  30.15 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  28.68 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  31.12 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.02 
 
 		 259 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  31.67 
 
 		 272 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  30.22 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  31.32 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  29.67 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  31.14 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  30.55 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  28.21 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  29.24 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  28.01 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  28.83 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  28.73 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  29.09 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  29.09 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>