More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0264 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0264  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 377 aa  770    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0672  D-alanyl-alanine synthetase A  54.26 
 
 		 377 aa  413  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00380934  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  52.66 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  40.37 
 
 		 375 aa  256  7e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  36.83 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  35.85 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  37.3 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  35.14 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  38.01 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  34.95 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  35.69 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  33.96 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  37.94 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  36.6 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  40.22 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  37.26 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  36.99 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  33.78 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  36.25 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  36.8 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  35.01 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  36.56 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  36.34 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  36.54 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  34.59 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  36.59 
 
 		 357 aa  212  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  34.66 
 
 		 393 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  35.16 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3672  D-alanine--D-alanine ligase  33.06 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  35.56 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  36.9 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  35.25 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  35.37 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  32.88 
 
 		 367 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  35.37 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  36.39 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  34.75 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  36.67 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  36.29 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  36.15 
 
 		 366 aa  206  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  34.69 
 
 		 360 aa  206  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  33.78 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  34.71 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  35.66 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  34.71 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  34.71 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1521  D-alanine--D-alanine ligase  33.87 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4346  D-alanine--D-alanine ligase A  33.87 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  33.78 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  34.4 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  33.51 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  33.87 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  33.87 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  34.4 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  33.87 
 
 		 361 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  36.41 
 
 		 351 aa  202  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  34.25 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  33.87 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  36 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  34.44 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  34.4 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  35.62 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  34.38 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  35 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  35.71 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  35.12 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  33.91 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  34.52 
 
 		 372 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  35.2 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  33.6 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  35.89 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  33.97 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  33.6 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  34.84 
 
 		 364 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  34.25 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  34.38 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  34.56 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  34.92 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  32.58 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  35.14 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  36.04 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  34.44 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  33.89 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  32.8 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  35.88 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  33.88 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  36.9 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  34.28 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>