274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1527 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  100 
 
 
351 aa  694    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0954  protein of unknown function/lipoprotein, putative  62.14 
 
 
349 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.231497  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  61.54 
 
 
356 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  55.81 
 
 
361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  56.15 
 
 
347 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  52.05 
 
 
351 aa  324  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  47.16 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  45.33 
 
 
363 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  42.54 
 
 
358 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0693  ABC transporter periplasmic protein  49.37 
 
 
371 aa  276  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000138325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  42.82 
 
 
358 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  42.25 
 
 
355 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  41.97 
 
 
358 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  41.69 
 
 
355 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  41.69 
 
 
355 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  41.69 
 
 
355 aa  265  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  41.69 
 
 
355 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  41.41 
 
 
355 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  41.97 
 
 
355 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  42.18 
 
 
361 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  40.06 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  42.99 
 
 
377 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  39.08 
 
 
351 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  40.95 
 
 
355 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  35.44 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  35.73 
 
 
340 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  32.58 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  41.52 
 
 
357 aa  182  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  36.02 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
356 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  38.83 
 
 
346 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  33.16 
 
 
354 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  35.17 
 
 
350 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  32.43 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  32.16 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  32.34 
 
 
360 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  35 
 
 
358 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  33.04 
 
 
371 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  35 
 
 
334 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  32.19 
 
 
338 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  33.52 
 
 
370 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0385  basic membrane protein A (bmpA), immunodominant antigen P39  31.13 
 
 
339 aa  154  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  32.66 
 
 
327 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  34.08 
 
 
342 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  35.94 
 
 
386 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  32.31 
 
 
329 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0755  basic membrane lipoprotein  31.25 
 
 
387 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  35.74 
 
 
347 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  33.89 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  33.54 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0384  basic membrane protein B (bmpB)  31.86 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  30.17 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  32.05 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  31.93 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  32.74 
 
 
341 aa  146  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  33.82 
 
 
366 aa  145  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  33.13 
 
 
332 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  29.61 
 
 
341 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  31.64 
 
 
358 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  31.84 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  32.4 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  29.92 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  33.43 
 
 
368 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  33.68 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  33.43 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  30.77 
 
 
713 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  30.53 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  31.4 
 
 
356 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  34.44 
 
 
358 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  32.42 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  29.92 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  31.31 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1950  membrane lipoprotein TmpC, putative  30.85 
 
 
357 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0939565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  30.84 
 
 
334 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0960  basic membrane lipoprotein  31.15 
 
 
358 aa  135  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  30.61 
 
 
389 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  32.8 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  29.75 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  32.8 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  33.56 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  28.74 
 
 
354 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1210  basic membrane lipoprotein  31.44 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.08 
 
 
331 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  32.08 
 
 
331 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  30.09 
 
 
329 aa  133  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  31.86 
 
 
331 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  30.86 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  32.5 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  31.59 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  30.27 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  31.21 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  31.09 
 
 
329 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  31.99 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  30.48 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1137  basic membrane lipoprotein  31.59 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3269  basic membrane lipoprotein  30.23 
 
 
389 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000111252  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  30.84 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  29.84 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  29.9 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  30.74 
 
 
380 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>