More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1412 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  67.75 
 
 		 472 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  67.53 
 
 		 472 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  100 
 
 		 503 aa  1004    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  62.31 
 
 		 485 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  62.31 
 
 		 485 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  52.59 
 
 		 511 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  52.39 
 
 		 511 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  53.21 
 
 		 720 aa  470  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  42.86 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  36.85 
 
 		 494 aa  310  5e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  35.31 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  30.44 
 
 		 494 aa  256  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  29.49 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  29.49 
 
 		 467 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  33.11 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 480 aa  231  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  31.28 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  29.44 
 
 		 474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  29.44 
 
 		 474 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  27.44 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  27.67 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  28.82 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  29.03 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  28.83 
 
 		 474 aa  206  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  27.56 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  27.56 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  30.85 
 
 		 475 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  30.32 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  30.38 
 
 		 473 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  29.68 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  25.61 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  25.78 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  25.78 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  25.78 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  25.78 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  31.46 
 
 		 782 aa  142  9.999999999999999e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  25.85 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  24.14 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  23.89 
 
 		 445 aa  107  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  23.86 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  23.86 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  25.78 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 		 497 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.87 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  22.98 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  22.63 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  23.65 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  21.3 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  23.24 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  23.24 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  23.24 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  23.09 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  21.21 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  21.21 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  21.21 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1400  amino acid permease family protein  22.15 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00116878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  21.21 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  23.03 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5194  putrescine transporter  23.14 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1212  amino acid permease yshA  22.15 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0367716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  22.03 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  23.15 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  23.15 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  21.11 
 
 		 476 aa  72  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  20.98 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  20.98 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2445  putrescine transporter  24.31 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273787  normal  0.196088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  24.08 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  23.23 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  21.2 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  23.57 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  24.92 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  22.86 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  22.86 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  22.86 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  22.59 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  22.59 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  22.86 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  22.86 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>