More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0235 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  59.43 
 
 		 244 aa  304  8.000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  56.34 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  43.03 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  42.86 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  41.87 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  40.24 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  40.24 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  39.43 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  39.43 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  39.43 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  39.43 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  39.43 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  39.43 
 
 		 249 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  39.43 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  36.48 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  37.3 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  37.3 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  35.51 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  38.11 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.2 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  34 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  30.95 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.51 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  30.16 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  26.14 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  25.82 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  25.82 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34.56 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  27.54 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  27.05 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  26.4 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  25.1 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25.2 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  24.8 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  29.63 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  27.24 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  29.34 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  28.86 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.71 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  24.27 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  25.28 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  24.89 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  27.52 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>