More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 308 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  63.67 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  60.47 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  55.66 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  54.06 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  50.17 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  53.17 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  55.89 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  55.74 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  44.55 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  48.34 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  45.61 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  37.91 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  44.87 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  44.19 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.58 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.13 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.46 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  46.88 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.91 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.91 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  36.63 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  36.63 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.79 
 
 		 299 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  39.74 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.61 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.96 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  47.9 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.86 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.05 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.34 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  40 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.62 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  39.74 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 303 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.43 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  39.06 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  38.23 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 316 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  38.67 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 398 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.59 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 		 314 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.16 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  42.19 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.21 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.16 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.07 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  28.88 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.53 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  38.01 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  30.28 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.04 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  42.15 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  35.29 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.76 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>