More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4413 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4413  Amidase  100 
 
 		 559 aa  1108    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  67.13 
 
 		 497 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  37.55 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  35.36 
 
 		 530 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  38.27 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  34.23 
 
 		 491 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  34.04 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  34.04 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  33.98 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  34.57 
 
 		 540 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  36.94 
 
 		 481 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  33 
 
 		 491 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  33.4 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  33.27 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  32.54 
 
 		 491 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  33.27 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  38.38 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  36.89 
 
 		 499 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  32.82 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  36.25 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  37 
 
 		 540 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  31.51 
 
 		 536 aa  220  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  31.31 
 
 		 536 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  30.51 
 
 		 536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  31.51 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  30.45 
 
 		 536 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  30.45 
 
 		 536 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  36.06 
 
 		 526 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  32.26 
 
 		 488 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  30.65 
 
 		 533 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  32.12 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  30.17 
 
 		 536 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  30.92 
 
 		 536 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  38.25 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  30.77 
 
 		 536 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  36.93 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  34.04 
 
 		 566 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  36.59 
 
 		 505 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  35.99 
 
 		 513 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  33.86 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  34.78 
 
 		 574 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  32.6 
 
 		 506 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  33.64 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  36.94 
 
 		 540 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.13 
 
 		 461 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  32.31 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  35.89 
 
 		 528 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  31.3 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  34.03 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  35.7 
 
 		 528 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  36.02 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  35.7 
 
 		 528 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  36.02 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  36.02 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  36.02 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  35.53 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  34.71 
 
 		 468 aa  176  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  30.38 
 
 		 570 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  32.8 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  30.62 
 
 		 567 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  34.32 
 
 		 484 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.95 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  38.61 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.88 
 
 		 491 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  30.61 
 
 		 567 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2932  amidase  29.81 
 
 		 567 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.17 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  29.64 
 
 		 567 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  35.38 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  29.69 
 
 		 568 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  29.48 
 
 		 584 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  30.69 
 
 		 592 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  30.21 
 
 		 569 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  29.25 
 
 		 568 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.24 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.36 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  32.47 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  29.04 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  29.04 
 
 		 568 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  28.7 
 
 		 584 aa  165  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  29.17 
 
 		 568 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.82 
 
 		 485 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  29.96 
 
 		 567 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  28.87 
 
 		 568 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.54 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.7 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  32.8 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.85 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  29.34 
 
 		 568 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.4 
 
 		 483 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  30.33 
 
 		 472 aa  160  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.73 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  34.55 
 
 		 484 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  31.11 
 
 		 494 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.54 
 
 		 491 aa  157  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  32.97 
 
 		 484 aa  157  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  30.29 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  30.84 
 
 		 569 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>