More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4311 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 307 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  69.81 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  70.89 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  74.22 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  62.13 
 
 		 304 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  61.51 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  64.38 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  54.75 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  55.7 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  60.13 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  48.71 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  55.07 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  53.05 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  48.63 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  48.7 
 
 		 306 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  52.58 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  47.88 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 343 aa  228  8e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  49.31 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.93 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.07 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.25 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.93 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  42.81 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  50.67 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.93 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.58 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.58 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.84 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.6 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  45.95 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.6 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  42.81 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  39.93 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.04 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.88 
 
 		 295 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  44.04 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.47 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  39.8 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  39.8 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  39.8 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.87 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40.89 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.32 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  46.73 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  42.62 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  47.76 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.5 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  37.46 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  41.16 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.82 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  41.16 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  41.16 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.82 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  43.45 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  33.54 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  38.66 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.93 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.66 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  32.96 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  42.19 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  40.64 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 342 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  40.64 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  30.17 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  31.84 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  40.28 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>