More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3025 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3025  secretory protein  100 
 
 		 150 aa  300  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1825  secretory protein  50.93 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0661752  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3024  secretory protein  67.19 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1318  secretory protein  45.31 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.011576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  58.93 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  49.18 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  58.93 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  38.17 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  44.12 
 
 		 176 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  35.85 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  44.78 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1121  hypothetical protein  72.73 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  33.85 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.67 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  33.08 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  45 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.67 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  47.54 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  43.08 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  36.26 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  45.16 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  47.54 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  50.98 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  46.38 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  39.74 
 
 		 160 aa  57  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  47.27 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  41.43 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  45.07 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  39.02 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  45.45 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  46.3 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  44.26 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  45.45 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  44.26 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  48.15 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  55.56 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  41.27 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  43.86 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  41.38 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  41.38 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  46.43 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  42.47 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.94 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.61 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  29.66 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  41.43 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  71.05 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.4 
 
 		 161 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>