More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1946 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 		 276 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 		 281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 		 276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 		 274 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 		 279 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.52 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 		 258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  37.93 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 295 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  42.34 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  44.2 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 274 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  40.81 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  41.24 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  39.19 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 280 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  41.01 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  40.58 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>