More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1929 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  68.08 
 
 
273 aa  346  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.33 
 
 
566 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4353  ABC transporter related  52.56 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.762556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3617  ABC transporter-related protein  52.12 
 
 
289 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.606564  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  51.6 
 
 
250 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  47.67 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 
276 aa  231  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 
282 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  50 
 
 
600 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.56 
 
 
546 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  48 
 
 
249 aa  228  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  47.37 
 
 
285 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
573 aa  228  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  45.8 
 
 
547 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  50.43 
 
 
308 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  47.37 
 
 
285 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
339 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  45.59 
 
 
285 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3390  ABC transporter related  47.49 
 
 
268 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  48.73 
 
 
549 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  46.9 
 
 
268 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 
423 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5508  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  42.97 
 
 
355 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.444532 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 
454 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  50.22 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  47.55 
 
 
587 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  43.8 
 
 
575 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  45.6 
 
 
572 aa  218  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  45.53 
 
 
536 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  44.49 
 
 
345 aa  218  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0369  ABC peptide transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 
277 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.719925  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
326 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1020  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
334 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113907  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.3 
 
 
712 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0468  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 
327 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.51 
 
 
568 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 
364 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.05 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136668  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
548 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
326 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0818  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
362 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
320 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43.75 
 
 
578 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3544  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
328 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  47.11 
 
 
552 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  40.7 
 
 
583 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 
326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 
321 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
736 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 
370 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1954  ABC transporter related  43.63 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 
366 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.86 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  41.5 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2828  ABC transporter related  44.62 
 
 
613 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  47.37 
 
 
597 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.32 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.86 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002963  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  44.54 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  47.26 
 
 
543 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  45.89 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2794  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1075  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.74 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  40.74 
 
 
552 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
571 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.13 
 
 
629 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.25 
 
 
325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  44.06 
 
 
555 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
478 aa  212  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 
329 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.97 
 
 
336 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
308 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  45.04 
 
 
308 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  44.71 
 
 
558 aa  211  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  41.31 
 
 
330 aa  211  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  40.46 
 
 
329 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.536054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
308 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  47.5 
 
 
686 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  44.09 
 
 
542 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  45.83 
 
 
550 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  45.45 
 
 
534 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.74 
 
 
319 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  44.66 
 
 
534 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>