More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0219 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0219  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 397 aa  781    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  37.19 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  35.86 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  36.55 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  35.48 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1955  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.173314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  24.38 
 
 		 646 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  33.8 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.1 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  30.87 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  40.16 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  35.17 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  36.6 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  36.6 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  36.6 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  34.43 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.1 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.3 
 
 		 648 aa  63.5  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  36.22 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.53 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  34.62 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  36.92 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  33.83 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  35.56 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 648 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  35.56 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  34.96 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  34.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.62 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  34.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.56 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  36.29 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  36.29 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  34.33 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  34.33 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  35.48 
 
 		 641 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  30.41 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  36.21 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.79 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  25.38 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.88 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  33.85 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  30.41 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  31.97 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  33.33 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  32.52 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  32.52 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  31.97 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  32.52 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  33.33 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  23.08 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.89 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  32.52 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  31.97 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  23.89 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  31.97 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  30.15 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  33.08 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  30.15 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  24.32 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  29.92 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  35.03 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.32 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  34.38 
 
 		 651 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  23.72 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  29.21 
 
 		 798 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  40.16 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  33.99 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  35.34 
 
 		 652 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.65 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  33.08 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>