100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4118 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4118  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 
163 aa  341  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.28 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  31.34 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  32.39 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  27.74 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  32.12 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  31.88 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2407  methylmalonyl-CoA epimerase  31.88 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  32.61 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  32.39 
 
 
134 aa  57.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_004310  BR0818  glyoxalase family protein  31.88 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  32.28 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  32.28 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  33.58 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  29.71 
 
 
134 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2043  methylmalonyl-CoA epimerase  29.71 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370344  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6135  methylmalonyl-CoA epimerase  29.31 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00511607  normal  0.152762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
134 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  31.19 
 
 
134 aa  53.9  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0906  methylmalonyl-CoA epimerase  31.11 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61726  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 
139 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1572  methylmalonyl-CoA epimerase  29.93 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1369  methylmalonyl-CoA epimerase  32.84 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0368  methylmalonyl-CoA epimerase  30.99 
 
 
134 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  28.89 
 
 
135 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  30.37 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1198  methylmalonyl-CoA epimerase  29.71 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1003  methylmalonyl-CoA epimerase  30.43 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1069  methylmalonyl-CoA epimerase  29.71 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17549  normal  0.247158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  30.71 
 
 
133 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  30.99 
 
 
134 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.43 
 
 
134 aa  50.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.61 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 
134 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.99 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  27.27 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  28.71 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  27.27 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  27.27 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.39 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2630  putative glyoxalase  30.99 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0581567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  30.77 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  27.27 
 
 
139 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  30.77 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  28.68 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  27.34 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  27.27 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  27.86 
 
 
137 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2814  methylmalonyl-CoA epimerase  25.17 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744827  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  29.27 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  29.58 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4617  methylmalonyl-CoA epimerase  27.74 
 
 
134 aa  47.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  26.32 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  26.52 
 
 
139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  25.71 
 
 
141 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  30.3 
 
 
135 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  31.82 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  26.87 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2869  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15489  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3282  methylmalonyl-CoA epimerase  26.15 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  26.43 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  26.12 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2934  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.794327  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  26.28 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  26.28 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2590  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
134 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.223231  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3210  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 
134 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0791094  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  25.76 
 
 
139 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
134 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269576  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  28.36 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.73 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  27.01 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4545  methylmalonyl-CoA epimerase  25.38 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0847692  normal  0.36006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  26.97 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.33 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  28.36 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  24.81 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1806  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.91 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2420  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.38 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.132451  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  23.76 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.96 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.295419  normal  0.1439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1282  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.922944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  25.2 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.82 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  26.14 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  24.64 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>