More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3491 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  65.14 
 
 		 221 aa  274  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  62.1 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  49.77 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  52.56 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  46.79 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6693  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 235 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3875  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000900168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0650  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000493918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3749  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.545663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3692  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0674602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0576  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00494054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0622  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  40.45 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  46.3 
 
 		 223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3006  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0615  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0124209  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  43.98 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  45.83 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  41.55 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>