More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2774 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  72.67 
 
 		 150 aa  223  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 167 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  70.67 
 
 		 154 aa  217  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 150 aa  200  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  62.66 
 
 		 172 aa  196  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  63.01 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  56.46 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000908  transcriptional regulator AsnC family  64.29 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.499259  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1316  AsnC family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 174 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.59 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 154 aa  119  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  41.38 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  40.41 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  40.69 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 181 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.44 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.1 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.76 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  39.73 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  42.33 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  42.33 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  42.33 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  42.33 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  42.33 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.33 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  42.33 
 
 		 222 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 222 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 163 aa  116  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  42.95 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>