113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1951 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1951  PfkB  100 
 
 
318 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  32.87 
 
 
283 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 
316 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  31.02 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  29.81 
 
 
224 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  28.77 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  28.23 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  27.7 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  29.7 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  28.52 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.23 
 
 
403 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.13 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  28.12 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.99 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  25.55 
 
 
279 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  22.97 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  27.39 
 
 
317 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  27.39 
 
 
317 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 
283 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  25.55 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  26.64 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  25.11 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  23.18 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  28.76 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  24.34 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  28.97 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  26.82 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  25.55 
 
 
283 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  40.86 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  24.9 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  33 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  24.78 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  23.04 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  22.41 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  25.56 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.43 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  23.79 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.09 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  26.37 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  26.01 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  25.11 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  23.67 
 
 
363 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  26.57 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 
300 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  34.85 
 
 
338 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.13 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  23.04 
 
 
333 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  24.57 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  28.63 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  25.96 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10546  predicted protein  23.91 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  24.06 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  25.08 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  24.06 
 
 
315 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  25.66 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  24.39 
 
 
297 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  24.46 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  25.64 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  23.73 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  24.1 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  24.4 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  24.1 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  26.43 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  31 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  23.74 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  33.33 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  26.55 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  23.93 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  23.74 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  29.52 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  38.82 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  30.36 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  25.58 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  39.66 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  25.19 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  21.84 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.08 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  25.45 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  25.45 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  25.45 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  25.45 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  25.45 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  29.41 
 
 
387 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  26.94 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  30.77 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  28.19 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  25.69 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  27.81 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  23.74 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  21.83 
 
 
291 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  24.41 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  24.75 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0716  rfaE bifunctional protein  24.15 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.511736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>