More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2710 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2710  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
322 aa  643    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2886  Nucleotidyl transferase  75.39 
 
 
322 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.619319  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1357  Nucleotidyl transferase  68.73 
 
 
324 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2798  Nucleotidyl transferase  66.77 
 
 
322 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1775  Nucleotidyl transferase  65.22 
 
 
324 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0199542 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1048  Nucleotidyl transferase  65.33 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3830  Nucleotidyl transferase  60.37 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1161  Nucleotidyl transferase  41.67 
 
 
238 aa  191  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  28.52 
 
 
357 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.2 
 
 
359 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  26.21 
 
 
361 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.25 
 
 
376 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.41 
 
 
355 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.65 
 
 
344 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.44 
 
 
357 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.71 
 
 
355 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.17 
 
 
355 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.82 
 
 
353 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  29.05 
 
 
402 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.43 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  29.09 
 
 
402 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.41 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.42 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  27.17 
 
 
411 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  26.17 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.84 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0258  nucleotidyl transferase  29.36 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.402702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  26.15 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  28.53 
 
 
364 aa  92.8  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
391 aa  92.4  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.27 
 
 
397 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.84 
 
 
355 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4103  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.89 
 
 
429 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4064  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.89 
 
 
429 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.54 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.86 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0868  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  25.9 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00134562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.79 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.28 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  25.85 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.97 
 
 
393 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.81 
 
 
357 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.65 
 
 
357 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.33 
 
 
357 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  27.17 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.43 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0782  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.71 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.36 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  26.99 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  27.31 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09931  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.44 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.545811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.86 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  27.41 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.27 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  27.79 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  31.45 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  25.14 
 
 
411 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  26.93 
 
 
832 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  27.27 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08071  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.97 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00949474  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  27.02 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0603  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.38 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00173495  normal  0.408623 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  28.66 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.56 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0473  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  25.44 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.21 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  25 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.15 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  32.66 
 
 
238 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  30.17 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  26.89 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.44 
 
 
418 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  25.9 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  25.96 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  27.25 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2020  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.46 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  26.36 
 
 
832 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  26.36 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  27.46 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16851  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.01 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  25.88 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  25.87 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.15 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1227  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.44 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.82 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  29.36 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1543  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.5 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00354872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.3 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42209  predicted protein  27.59 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000356266  hitchhiker  0.000000600938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  27.03 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  28.94 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  26.99 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.41 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>