108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2097 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
336 aa  635    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  50.93 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  46.79 
 
 
376 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  44.12 
 
 
341 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  28.09 
 
 
346 aa  102  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 
363 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  25.32 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  28.5 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  27.51 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  27.98 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  26.37 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  20.9 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  24.45 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  28.49 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  30.65 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.94 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  26.17 
 
 
348 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.98 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  23.98 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.78 
 
 
394 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  21.36 
 
 
368 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.53 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 
378 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  26.03 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  25.23 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.33 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  25.23 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  24.31 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  23.33 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  25.44 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.47 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  24.43 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  27.74 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.59 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.59 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.89 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  25.6 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  25.53 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.59 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  25.3 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.69 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  23.9 
 
 
356 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.68 
 
 
354 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.56 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  28.65 
 
 
396 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  26.4 
 
 
364 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  34.95 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  24.54 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  26.4 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  26.14 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  26.14 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  31.48 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  23.86 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  36.52 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  21.47 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  26.38 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  24.85 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 
398 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  27.91 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 
438 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  27.56 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  28.08 
 
 
406 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  28.02 
 
 
358 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  28.08 
 
 
406 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  26.92 
 
 
360 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  25.34 
 
 
352 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  28.07 
 
 
368 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  25.34 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  34.13 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  25.62 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  26.01 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  39.56 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  39.44 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  39.44 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  39.44 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  27.73 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.4 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  30.88 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.75 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  28.39 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  23.96 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.3 
 
 
347 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  27.01 
 
 
362 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.88 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  37.76 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>