62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1379 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  75.04 
 
 
653 aa  919    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  68.24 
 
 
625 aa  813    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0611  ATPase-like protein  74.48 
 
 
618 aa  940    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1658  hypothetical protein  76.68 
 
 
604 aa  963    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208487  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1379  hypothetical protein  100 
 
 
604 aa  1231    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  44.93 
 
 
783 aa  510  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  43.02 
 
 
605 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2787  hypothetical protein  31.09 
 
 
624 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  25.7 
 
 
651 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  23.99 
 
 
539 aa  57.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  33.59 
 
 
427 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.35 
 
 
569 aa  54.3  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  33 
 
 
569 aa  52.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  26.34 
 
 
546 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  30.48 
 
 
591 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  22.67 
 
 
508 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.02 
 
 
496 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  28.8 
 
 
600 aa  50.8  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  26.82 
 
 
510 aa  50.8  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  28.1 
 
 
581 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  27.12 
 
 
574 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  31.5 
 
 
554 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  35.35 
 
 
532 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  25.86 
 
 
609 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  42.86 
 
 
600 aa  49.7  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  27.78 
 
 
570 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  33.33 
 
 
594 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  32.67 
 
 
540 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  30.43 
 
 
567 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  26.89 
 
 
608 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  26.89 
 
 
608 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  35.21 
 
 
599 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  24.16 
 
 
530 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  24.08 
 
 
708 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  22.98 
 
 
595 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  36.71 
 
 
575 aa  47.4  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  30.12 
 
 
526 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  23.6 
 
 
530 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  24.16 
 
 
530 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  25.71 
 
 
607 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.16 
 
 
587 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  22.94 
 
 
531 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.73 
 
 
679 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.5 
 
 
579 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  20.75 
 
 
557 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  21.86 
 
 
529 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  26.32 
 
 
591 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.57 
 
 
360 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  24.72 
 
 
534 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  24.22 
 
 
612 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  28.19 
 
 
591 aa  44.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  25 
 
 
579 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  31.82 
 
 
714 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4789  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.22 
 
 
514 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  32.35 
 
 
623 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  30.26 
 
 
544 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.55 
 
 
524 aa  43.9  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.28 
 
 
520 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.98 
 
 
513 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  23.29 
 
 
540 aa  43.9  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0795  ATPase-like protein  31.36 
 
 
396 aa  43.9  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.412059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.43 
 
 
643 aa  43.9  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>