More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0420 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  63.93 
 
 
64 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  50.85 
 
 
835 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
852 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  50.85 
 
 
955 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  50.85 
 
 
961 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
939 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
825 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 
790 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  46.88 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 
913 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  48.33 
 
 
907 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  50 
 
 
907 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 
793 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  49.18 
 
 
834 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  48.44 
 
 
792 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  47.69 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  49.23 
 
 
739 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  47.46 
 
 
955 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  42.11 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
789 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  49.18 
 
 
833 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
762 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
762 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
767 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
762 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 
855 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  40.32 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  40.62 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 
740 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2186  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  44.62 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
871 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
762 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  46.88 
 
 
792 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  49.23 
 
 
867 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
839 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
737 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  40.98 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  44.26 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
1013 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  47.54 
 
 
833 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  47.54 
 
 
833 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  47.54 
 
 
833 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  47.54 
 
 
833 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  45.9 
 
 
832 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  47.54 
 
 
833 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
804 aa  50.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  44.62 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
841 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
741 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  45.16 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  45.16 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  45.16 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
759 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
826 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 
885 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
792 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
829 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  40.32 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.06 
 
 
70 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
860 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
827 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
859 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
1040 aa  48.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
971 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
840 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  50 
 
 
71 aa  48.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 
824 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  42.86 
 
 
833 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>