More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4161 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4161  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  100 
 
 
507 aa  1005    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174891  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4745  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  66.67 
 
 
507 aa  663    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.750751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1037  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  53.14 
 
 
565 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4121  NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit, iron sulphur binding protein  46.2 
 
 
495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.79 
 
 
597 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.25 
 
 
677 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  28.09 
 
 
597 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  27.25 
 
 
607 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  27.25 
 
 
607 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 
632 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 
545 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  25.52 
 
 
614 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
407 aa  143  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
545 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  27.89 
 
 
634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  26.17 
 
 
597 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  27.87 
 
 
626 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  25.73 
 
 
594 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  29.01 
 
 
623 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
602 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  25.49 
 
 
610 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1539  NADH dehydrogenase (quinone)  26.77 
 
 
580 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  28.73 
 
 
626 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  29.04 
 
 
626 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2794  NADH dehydrogenase (quinone)  26.24 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  26.11 
 
 
604 aa  134  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1024  NADH dehydrogenase (quinone)  27.62 
 
 
407 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  25.78 
 
 
545 aa  133  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  25.68 
 
 
624 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  29.74 
 
 
488 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  25.25 
 
 
595 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
538 aa  131  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  28.07 
 
 
619 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  28.85 
 
 
407 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2683  NADH dehydrogenase (quinone)  29.92 
 
 
511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  27.38 
 
 
575 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  27.02 
 
 
526 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  25.83 
 
 
596 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  26.46 
 
 
590 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  25.64 
 
 
572 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1517  NADH dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  29.09 
 
 
627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0989  NADH dehydrogenase (quinone)  27.04 
 
 
516 aa  128  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  25.87 
 
 
614 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  27.36 
 
 
486 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  27.36 
 
 
486 aa  127  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  23.93 
 
 
588 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  27.23 
 
 
617 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4997  NADH dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 
519 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000202694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  25.49 
 
 
570 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  27.13 
 
 
486 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  25.19 
 
 
598 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  27.85 
 
 
539 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  24.75 
 
 
603 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  25.35 
 
 
597 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  25.83 
 
 
636 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  26.1 
 
 
600 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  30.38 
 
 
421 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  26.98 
 
 
593 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  25.76 
 
 
620 aa  123  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  25.29 
 
 
636 aa  123  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  27.31 
 
 
570 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3090  putative formate dehydrogenase beta subunit  27.79 
 
 
518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574941  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  26.34 
 
 
624 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0109  NADH dehydrogenase (quinone)  25.44 
 
 
656 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  25.34 
 
 
597 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  27.15 
 
 
597 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  27.39 
 
 
594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4913  NADH dehydrogenase (quinone)  26.69 
 
 
519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.849952  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1701  NADH dehydrogenase (quinone)  27.47 
 
 
604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  25.83 
 
 
562 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  25.76 
 
 
591 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  28.95 
 
 
439 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  26.7 
 
 
591 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  25.29 
 
 
571 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  25.48 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  27.42 
 
 
592 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  24.81 
 
 
569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1217  hydrogenase, NADP-reducing subunit C  27.68 
 
 
588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.180172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  28.2 
 
 
442 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1923  NADH dehydrogenase (quinone)  28.11 
 
 
539 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  26.76 
 
 
535 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4405  NADH dehydrogenase (quinone)  26.89 
 
 
519 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4868  NADH dehydrogenase (quinone)  26.8 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0784  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0166  NADH dehydrogenase (quinone)  29.58 
 
 
612 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  26.23 
 
 
593 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  27.21 
 
 
629 aa  116  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  25.9 
 
 
562 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  26.16 
 
 
593 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  28.27 
 
 
530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0256  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  27.17 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  25.8 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4116  hydrogen dehydrogenase  27.87 
 
 
603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502813  normal  0.19956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1808  NADH dehydrogenase (quinone)  28.63 
 
 
519 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  24.9 
 
 
596 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  24.86 
 
 
623 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1522  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  27.17 
 
 
602 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000148322  hitchhiker  0.000569435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>