More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2683 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2683  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 511 aa  1017    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4997  NADH dehydrogenase (quinone)  63.04 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0256  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  62.4 
 
 		 519 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4913  NADH dehydrogenase (quinone)  60.47 
 
 		 519 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.849952  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3090  putative formate dehydrogenase beta subunit  59.96 
 
 		 518 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4405  NADH dehydrogenase (quinone)  61.07 
 
 		 519 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4868  NADH dehydrogenase (quinone)  60.67 
 
 		 519 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2353  NADH dehydrogenase (quinone)  62.2 
 
 		 519 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.691857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2275  NADH dehydrogenase (quinone)  59.45 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.321914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3926  NADH dehydrogenase (quinone)  59.09 
 
 		 518 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3637  NADH dehydrogenase (quinone)  58.89 
 
 		 518 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288209  normal  0.948278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4098  NADH dehydrogenase I chain F  58.13 
 
 		 518 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3480  NADH dehydrogenase (quinone)  59.6 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3807  normal  0.394192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2384  NADH dehydrogenase (quinone)  59.09 
 
 		 518 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4023  formate dehydrogenase, beta subunit  56.7 
 
 		 537 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3018  NADH dehydrogenase (quinone)  58.46 
 
 		 519 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2857  NADH dehydrogenase (quinone)  58.76 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0721  NADH dehydrogenase (quinone)  57.59 
 
 		 516 aa  588  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0554  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  59.13 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0725  NADH dehydrogenase (quinone)  59.88 
 
 		 518 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0989  NADH dehydrogenase (quinone)  59.26 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2184  NADH dehydrogenase (quinone)  59.27 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2057  formate dehydrogenase, beta subunit  56.02 
 
 		 534 aa  581  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.657575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3553  NADH dehydrogenase (quinone)  59.39 
 
 		 519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2751  NADH dehydrogenase (quinone)  58.15 
 
 		 523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1707  NADH dehydrogenase (quinone)  58.38 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2898  NADH dehydrogenase (quinone)  57.51 
 
 		 518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1474  NADH dehydrogenase (quinone)  59.43 
 
 		 516 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.489293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0804  NADH dehydrogenase (quinone)  59.72 
 
 		 518 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  59.52 
 
 		 518 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  57.23 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2740  NADH dehydrogenase (quinone)  57.48 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0618  NADH dehydrogenase (quinone)  59.69 
 
 		 521 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2854  NADH dehydrogenase (quinone)  59.41 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1079  NAD dependent formate dehydrogenase, beta subunit (51 kDa)  57.48 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2559  NADH dehydrogenase (quinone)  57.68 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1392  formate dehydrogenase, beta subunit  57.68 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1808  NADH dehydrogenase (quinone)  58.77 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0840  NADH dehydrogenase (quinone)  58.7 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.882058  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3709  NADH dehydrogenase (quinone)  59.1 
 
 		 520 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4646  NADH dehydrogenase (quinone)  58.61 
 
 		 518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1860  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  59.62 
 
 		 727 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1623  formate dehydrogenase, beta subunit  57.23 
 
 		 522 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0181  formate dehydrogenase, beta subunit  56.24 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0449  formate dehydrogenase, beta subunit  56.24 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3011  NAD-dependent formate dehydrogenase beta subunit  56.24 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0966  formate dehydrogenase, beta subunit  56.24 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2901  formate dehydrogenase, beta subunit  56.24 
 
 		 521 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2963  formate dehydrogenase, beta subunit  56.24 
 
 		 527 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2594  formate dehydrogenase, beta subunit  56.24 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  58.81 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0388  NADH dehydrogenase (quinone)  54.92 
 
 		 523 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0553  NADH dehydrogenase (quinone)  58.81 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1032  NADH dehydrogenase (quinone)  58.81 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0728  NADH dehydrogenase (quinone)  55.23 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  0.849063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4145  NADH dehydrogenase (quinone)  57.32 
 
 		 525 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0896  NADH dehydrogenase (quinone)  57.54 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0908  NADH dehydrogenase (quinone)  57.32 
 
 		 525 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0101124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0965  NAD-dependent formate dehydrogenase, beta subunit  57.84 
 
 		 521 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3022  NADH dehydrogenase (quinone)  55.58 
 
 		 520 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689492  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2365  NADH dehydrogenase (quinone)  57.96 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0733  NADH dehydrogenase (quinone)  53.37 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0030  NADH dehydrogenase (quinone)  48.82 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  38.92 
 
 		 614 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  39.06 
 
 		 602 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  44.18 
 
 		 607 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  44.18 
 
 		 607 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  39.31 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 		 594 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  37.87 
 
 		 614 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  40.04 
 
 		 604 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  39.47 
 
 		 545 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2479  NADH dehydrogenase (quinone)  40.51 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.858375  normal  0.575903 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  43.27 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.71 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  42.48 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  39.92 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4654  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  42.42 
 
 		 535 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1018  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 		 407 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  40.87 
 
 		 590 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  37.35 
 
 		 597 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 		 545 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  43 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  43.24 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1828  NADH dehydrogenase (quinone)  42.58 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  44.55 
 
 		 539 aa  356  5e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3542  NADH dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1365  NADH dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 		 532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 596 aa  352  7e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  39.53 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 		 597 aa  350  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  41.98 
 
 		 538 aa  350  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  38.62 
 
 		 597 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  42.58 
 
 		 486 aa  349  6e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 		 570 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  36.64 
 
 		 595 aa  348  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  41.01 
 
 		 624 aa  349  9e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  42.58 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  41.22 
 
 		 634 aa  347  3e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>