78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2341 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2341  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  834    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 
427 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
413 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1984  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
458 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.179831 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.42 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.11 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.54 
 
 
444 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.98 
 
 
394 aa  54.3  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
415 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0498  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000266788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  21.68 
 
 
387 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
424 aa  50.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  22.76 
 
 
384 aa  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  23.24 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  20.97 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04370  putative MFS transporter  26.18 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  24.01 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.93 
 
 
407 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
390 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  24.08 
 
 
416 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  29 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  22.08 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  28.36 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 
522 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  23.14 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.37 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.1 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.29 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.6 
 
 
409 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.74 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.74 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  28.75 
 
 
222 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  25.68 
 
 
432 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.14 
 
 
461 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  25.52 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  23.86 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 
524 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  25.32 
 
 
382 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
522 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0426  MFS family transporter  28.83 
 
 
399 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  28.89 
 
 
472 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  25.93 
 
 
414 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  26.05 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
389 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  22.76 
 
 
604 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 
737 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
404 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  22.33 
 
 
404 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.99 
 
 
432 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  23.63 
 
 
373 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  21.73 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  21.73 
 
 
392 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.47 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  21.73 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  23.42 
 
 
383 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  26.41 
 
 
422 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
408 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  28 
 
 
438 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 
483 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.19 
 
 
390 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>