45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6876 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  40.68 
 
 
309 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  38.27 
 
 
339 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  38.85 
 
 
325 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  26.83 
 
 
318 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  34.32 
 
 
320 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  36.36 
 
 
326 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  26.52 
 
 
318 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  36.77 
 
 
346 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  36.84 
 
 
315 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  37.46 
 
 
327 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  37.76 
 
 
323 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  38.08 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  26.33 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  33.79 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  34.34 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  27.82 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  33.22 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  35.04 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  27.65 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  27.33 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  22.53 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  24.56 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  24.21 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
586 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  25.63 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  23.21 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  30.97 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  18.75 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.49 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  20.94 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  24.7 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  30.07 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  33.56 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  33.56 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.74 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  33.56 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  25.7 
 
 
326 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.41 
 
 
333 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  31.54 
 
 
367 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  25.42 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  28.28 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  28.62 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  31.54 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  29.29 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>