More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4648 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.06 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.54 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1606  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1511  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.28 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0055126  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 		 151 aa  121  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.95 
 
 		 147 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 251 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  31.86 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  32.18 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  32.18 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  31.86 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.84 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  34.13 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 252 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 252 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  33.33 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.82 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  34.33 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.11 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  34.87 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  32.44 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  32.44 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  34.65 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  32.44 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  34.87 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  34.87 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.83 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  33.33 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  32.88 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  30.7 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  30.7 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.5 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  31.31 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.5 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.74 
 
 		 268 aa  95.5  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.19 
 
 		 245 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.71 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  31.31 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  33.5 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.51 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  33.5 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  31.82 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  30.93 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  37.11 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.93 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  33.5 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  33.5 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  30.46 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  33.5 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  31.86 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  32.31 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  32.32 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  32.32 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.98 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>