89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4372 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 270 aa  531  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  51.18 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  52.77 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  50.81 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  50.41 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  47.28 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  50.63 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  47.15 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  47.13 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  47.81 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  47.86 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  47.5 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  44.35 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  47.28 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  45.93 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  47.72 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  44.21 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  44.08 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  50 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.6 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  34.19 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  33.76 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  33.76 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  34.05 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.09 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 297 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  22.53 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  26.46 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  38.78 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  30.87 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  27.47 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.87 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  22.76 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  22.46 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  34.53 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3282  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  29.73 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 831 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.87 
 
 		 313 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>