More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3753 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
908 aa  1776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2734  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.2 
 
 
652 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2640  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.2 
 
 
651 aa  376  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1225  DEAD/DEAH box helicase  49.2 
 
 
628 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.75882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2544  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.86 
 
 
680 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.711022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.85 
 
 
550 aa  357  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.7 
 
 
634 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48 
 
 
584 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40 
 
 
637 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.84 
 
 
611 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.24 
 
 
530 aa  343  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  40.23 
 
 
640 aa  342  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1046  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51 
 
 
627 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.835563  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.17 
 
 
541 aa  342  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.87 
 
 
541 aa  341  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.71 
 
 
643 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41 
 
 
664 aa  340  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41 
 
 
664 aa  340  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41 
 
 
664 aa  340  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.32 
 
 
646 aa  339  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.5 
 
 
590 aa  339  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.04 
 
 
610 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.55 
 
 
599 aa  336  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  46.81 
 
 
624 aa  336  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.71 
 
 
622 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.34 
 
 
629 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.71 
 
 
622 aa  335  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  42.89 
 
 
656 aa  335  3e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  42.34 
 
 
629 aa  334  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.34 
 
 
629 aa  334  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  49.01 
 
 
561 aa  334  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.34 
 
 
629 aa  334  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  42.34 
 
 
629 aa  334  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.34 
 
 
629 aa  334  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.19 
 
 
531 aa  334  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.61 
 
 
606 aa  334  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.93 
 
 
546 aa  333  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.41 
 
 
533 aa  333  8e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.34 
 
 
651 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  49.29 
 
 
562 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.77 
 
 
621 aa  333  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.7 
 
 
546 aa  333  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.34 
 
 
651 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44 
 
 
467 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.34 
 
 
651 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  45.86 
 
 
581 aa  333  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
640 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.11 
 
 
655 aa  332  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.51 
 
 
640 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.57 
 
 
497 aa  332  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
640 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.86 
 
 
623 aa  331  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  45.21 
 
 
632 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.24 
 
 
640 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
640 aa  331  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.12 
 
 
564 aa  331  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  38.66 
 
 
574 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.21 
 
 
561 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.95 
 
 
653 aa  330  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 
532 aa  330  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.93 
 
 
657 aa  330  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
605 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.65 
 
 
539 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.01 
 
 
511 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.88 
 
 
589 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1726  RNA helicase DeaD  39.55 
 
 
611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.12 
 
 
629 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.2 
 
 
538 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.12 
 
 
629 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.12 
 
 
629 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.12 
 
 
629 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  42.61 
 
 
572 aa  328  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.17 
 
 
532 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.12 
 
 
629 aa  328  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.24 
 
 
589 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44 
 
 
623 aa  327  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.59 
 
 
625 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  39.34 
 
 
591 aa  327  7e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.11 
 
 
559 aa  327  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.47 
 
 
528 aa  327  9e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  43.47 
 
 
528 aa  327  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.47 
 
 
528 aa  327  9e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.71 
 
 
669 aa  327  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.47 
 
 
528 aa  327  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.47 
 
 
525 aa  326  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 
529 aa  326  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.49 
 
 
505 aa  326  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  43.47 
 
 
528 aa  326  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  43.47 
 
 
533 aa  326  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
527 aa  326  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.05 
 
 
614 aa  326  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.47 
 
 
525 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.8 
 
 
590 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.3 
 
 
610 aa  325  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3352  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.02 
 
 
741 aa  324  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.55 
 
 
602 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  44.63 
 
 
529 aa  324  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.91 
 
 
619 aa  324  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.73 
 
 
595 aa  323  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.32 
 
 
599 aa  323  7e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>