More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3367 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  100 
 
 
291 aa  577  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  48.19 
 
 
298 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
288 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  44.22 
 
 
307 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  43.92 
 
 
307 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
299 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  43.58 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  40.93 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  39.43 
 
 
284 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  36.65 
 
 
295 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
290 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
299 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
293 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  36.79 
 
 
299 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 
299 aa  175  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  38.37 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  37 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  37.65 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  37.72 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  34.8 
 
 
299 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  37.82 
 
 
297 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
298 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
298 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
298 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
298 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  34.91 
 
 
298 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  34.63 
 
 
298 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  35.27 
 
 
298 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  35.27 
 
 
298 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  35.27 
 
 
298 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  33.92 
 
 
298 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  37.82 
 
 
282 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
291 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  35.16 
 
 
288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
297 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  34.41 
 
 
295 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  33.94 
 
 
293 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
292 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  34.66 
 
 
292 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  35.09 
 
 
274 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  38.06 
 
 
310 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  36.4 
 
 
311 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  32.73 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  32.82 
 
 
293 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
286 aa  149  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 
307 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  34.18 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.51 
 
 
287 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.71 
 
 
290 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.15 
 
 
287 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.51 
 
 
287 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  35.76 
 
 
290 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.71 
 
 
290 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.37 
 
 
290 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.54 
 
 
290 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  33.68 
 
 
292 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  31.79 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  33.93 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.58 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  32.24 
 
 
286 aa  139  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  32.07 
 
 
305 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  35.09 
 
 
298 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  30.66 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
290 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  37.5 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  33.33 
 
 
300 aa  135  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  33.93 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.39 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  33.68 
 
 
285 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.55 
 
 
285 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  33.67 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 
286 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
290 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
290 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  32.86 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  32.86 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  32.01 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.11 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  32.87 
 
 
299 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.8 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.37 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  31.13 
 
 
284 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  36.6 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0461  aminotransferase, class IV  33.57 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  34.15 
 
 
278 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.21 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4206  aminotransferase class IV  31.54 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  34.81 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>