More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3248 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  48.24 
 
 		 1538 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 1542 aa  3135    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 		 1557 aa  685    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  47.26 
 
 		 1537 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  48.12 
 
 		 1538 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 918 aa  360  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 903 aa  326  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 824 aa  312  4e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 887 aa  291  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 812 aa  288  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 825 aa  288  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  30.28 
 
 		 824 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 825 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 576 aa  280  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  30.11 
 
 		 824 aa  278  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 570 aa  274  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  29.61 
 
 		 811 aa  270  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  32.69 
 
 		 624 aa  268  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 620 aa  263  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 572 aa  260  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 607 aa  259  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 610 aa  259  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 633 aa  259  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 564 aa  255  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 562 aa  254  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 610 aa  253  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 605 aa  251  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 610 aa  249  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  32.87 
 
 		 564 aa  248  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.83 
 
 		 610 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.34 
 
 		 610 aa  246  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 609 aa  245  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 603 aa  241  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.12 
 
 		 575 aa  240  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  24.66 
 
 		 819 aa  233  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  27.79 
 
 		 606 aa  231  7e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 605 aa  220  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 553 aa  220  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 603 aa  219  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 620 aa  218  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 854 aa  217  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 525 aa  218  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  31.83 
 
 		 580 aa  215  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 580 aa  215  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 603 aa  214  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.83 
 
 		 512 aa  214  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 520 aa  213  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  25.22 
 
 		 826 aa  212  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 592 aa  211  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  29.02 
 
 		 515 aa  211  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  23.17 
 
 		 829 aa  211  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 508 aa  211  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 601 aa  208  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 663 aa  207  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 492 aa  206  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 633 aa  206  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.51 
 
 		 514 aa  206  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 605 aa  204  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.15 
 
 		 513 aa  203  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 612 aa  204  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1829  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 657 aa  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 601 aa  202  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 596 aa  202  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.63 
 
 		 500 aa  201  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.25 
 
 		 510 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 637 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 521 aa  200  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 511 aa  199  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 561 aa  199  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 602 aa  199  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 521 aa  199  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 518 aa  198  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 750 aa  197  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 605 aa  197  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 605 aa  197  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 506 aa  196  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 512 aa  196  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 553 aa  196  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 520 aa  196  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.3 
 
 		 602 aa  195  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 630 aa  194  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 597 aa  194  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 597 aa  194  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.77 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.77 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.55 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.77 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.47 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.42 
 
 		 510 aa  194  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 569 aa  194  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 593 aa  193  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.96 
 
 		 510 aa  193  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.05 
 
 		 552 aa  193  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.55 
 
 		 510 aa  193  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.41 
 
 		 555 aa  193  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 557 aa  193  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 597 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 591 aa  193  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 607 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 602 aa  192  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>