More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1083 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1083  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 
311 aa  618  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2735  hypothetical protein  32.82 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2608  hypothetical protein  33.2 
 
 
295 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3072  HMG-CoA lyase-like  34.98 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357205  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0987  hypothetical protein  28.69 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.861522  normal  0.983085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2258  pyruvate carboxyltransferase  32.86 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13506  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.69 
 
 
336 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.88 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0140  pyruvate carboxyltransferase  25.31 
 
 
352 aa  89  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000672144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1791  aldolase/synthase, putative  28.09 
 
 
534 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.41 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  35.88 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  34.34 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.26 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.2 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  31.95 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.59 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.28 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2070  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  27.95 
 
 
522 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0358  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  28.57 
 
 
530 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.94 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.74 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.8 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  25 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0743  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  25.72 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01640  nitrogen fixation homocitrate synthase  26.5 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  27.64 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1506  homocitrate synthase  25.98 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  23.57 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1224  homocitrate synthase  25.98 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2038  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.3 
 
 
523 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.815773  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  22.06 
 
 
522 aa  72.8  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  28.2 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10900  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  21.77 
 
 
524 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.59 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  27.99 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1190  homocitrate synthase  26.46 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000085234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.41 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.08 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.08 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0279  homocitrate synthase  27.69 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  25.27 
 
 
511 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.51 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.8 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.25 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.89 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.66 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.31 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.51 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  24.91 
 
 
516 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1585  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  20.45 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.81 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.79 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.87 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  33.14 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0727  hypothetical protein  24.21 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.51 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.94 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.94 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.57 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0833  pyruvate carboxyltransferase  26.28 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  21.43 
 
 
514 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  29.89 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  21.79 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  25.37 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1102  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  22.54 
 
 
526 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2251  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  24.9 
 
 
533 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.05 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1879  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  24.71 
 
 
528 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0189778  hitchhiker  0.000402835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.04 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  21.71 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.04 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  21.35 
 
 
514 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.85 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1194  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  23.76 
 
 
524 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3364  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.79 
 
 
530 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0183471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3018  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  27.27 
 
 
528 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1102  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  24.34 
 
 
557 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1398  pyruvate carboxyltransferase  26.1 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.321846  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4071  homocitrate synthase  25.4 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00164533  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  29.35 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  30.26 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  28.74 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  25.5 
 
 
515 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  25.08 
 
 
509 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  25.08 
 
 
509 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  23.17 
 
 
520 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1022  pyruvate carboxyltransferase  24.19 
 
 
287 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0108  2-isopropylmalate synthase/homocitrate synthase family protein  20.93 
 
 
529 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1798  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  25.87 
 
 
528 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0044129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1265  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  27.13 
 
 
528 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000833314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2055  2-isopropylmalate synthase  23.79 
 
 
404 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  24.81 
 
 
516 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2313  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  26.8 
 
 
522 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2269  pyruvate carboxyltransferase  23.26 
 
 
392 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319025  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1818  2-isopropylmalate synthase  23.93 
 
 
355 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1723  2-isopropylmalate synthase  24.07 
 
 
409 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.35 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  22.42 
 
 
511 aa  63.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>